Im Rahmen des Plangenehmigungsverfahrens gegen die Erneuerung der Clarastrasse wurden im Sommer 2023 Einsprachen eingelegt, die bis Januar 2025 abgewiesen wurden. Diese rechtlichen Schritte führten zu weiteren Verzögerungen bei notwendigen Gleissanierungen und Umbauten der Haltestellen. Die genaue Dauer der Verzögerung und die finanziellen Konsequenzen sind derzeit unklar. Das Tiefbauamt kann erst nach den Gleis- und Leitungsarbeiten mit der Sanierung der Trottoirs und der Pflanzung neuer Bäume beginnen. Die Basler Verkehrs-Betriebe und das Bau- und Verkehrsdepartement streben an, beim Bundesverwaltungsgericht die Aufhebung der Beschwerde zu beantragen, um die Gleise und Bushaltestelle bis Herbst 2025 zu erneuern.
Einige Bauarbeiten können bereits ohne Baubewilligung fortgesetzt werden. So wird die Haltestelle „Messeplatz“ bis zur Fasnacht 2025 umgebaut, um einen stufenlosen Zugang zu gewährleisten. In der Fasnachtszeit ruhen die Arbeiten, die ab Mitte März bis Ende April 2025 wieder aufgenommen werden. Auch während bedeutender Veranstaltungen wie der Art Basel und dem Eurovision Song Contest 2025 sind Bauarbeiten eingestellt. Seit April 2023 arbeiten die BVB und IWB an der Erneuerung der Clarastrasse, wobei bereits die Energie- und Wasserleitungen saniert wurden.
